建武二年（公元26年 丙戌年）
春天，正月初一，出现了日食。
刘恭心里明白赤眉军肯定得败，就偷偷教弟弟刘盆子归还玉玺，还让他练习一些辞让的话。等到正月初一大家聚会的时候，刘恭先开口说：“各位一起拥立我弟弟做皇帝，这情义实在是深厚！但这都快一年了，局势却越来越乱，看来确实不适合继续这样下去，我怕这样下去就算死了也没啥用。我希望能让我弟弟退位当老百姓，咱们再找个贤能的人。希望各位好好考虑考虑！”樊崇等人赶紧道歉说：“这都是我们的错啊。”刘恭又坚持请求，有人就说：“这难道只是你式侯的事吗？”刘恭吓得赶紧起身离开。这时候刘盆子从座位上下来，解下玉玺，磕头说：“现在虽然有了皇帝，可大家还是跟强盗一样，到处招人怨恨，老百姓也不再信任归附我们，这都是因为没选对人啊。我希望能辞去皇位，给贤能的人让路！要是你们非要杀我来承担责任，我也没二话！”说着就哭哭啼啼起来。樊崇等人和在场的几百人，没有不觉得可怜的，都赶紧离开座位，磕头说：“我们太不像话，辜负了陛下，请陛下放心，从今往后，绝对不敢再乱来！”说完大家一起抱住刘盆子，给他带上玉玺。刘盆子又哭又喊，没办法还是继续当这个皇帝。散会之后，大家各自回营，紧闭营门，好好守着。三辅地区的人都觉得这皇帝挺聪明，老百姓都争着回到长安，城里的集市都快挤满了。可过了二十多天，赤眉军又出来了，还是跟以前一样大肆抢掠。
刁子都被他的部下给杀了，他的残余势力和其他贼寇在檀乡会合，号称檀乡贼，在魏郡、清河一带捣乱。魏郡的大官李熊的弟弟李陆打算谋反，想打开城门迎接檀乡贼。有人把这事告诉了魏郡太守颍川人铫期，铫期就把李熊叫来问话，李熊磕头认罪，说愿意和老母亲一起受死。铫期说：“要是当官吏还不如当贼快乐，你可以回去，和老母亲一起去找李陆。”还派小吏把他送出城。李熊走了之后，找到了李陆，带着他来到邺城西门。李陆特别羞愧感动，觉得对不起铫期，就自杀谢罪了。铫期感叹不已，按照礼节把他安葬，还让李熊官复原职。从此，郡里的人都对铫期的威信心服口服。刘秀派吴汉率领王梁等九位将军，在邺城东边的漳水上攻打檀乡贼，把他们打得大败，十多万人都投降了。又派王梁和大将军杜茂带兵去安抚魏郡、清河、东郡，把那些营寨堡垒都平定了，这三个郡恢复了安宁，道路也畅通无阻。
正月二十七日，刘秀把各位功臣都封为列侯。梁侯邓禹、广平侯吴汉都享有四个县的封地。博士丁恭提意见说：“以前分封诸侯，封地不超过百里，这是为了加强中央，削弱地方，治理国家就得这样。现在封四个县，不符合制度啊。”刘秀说：“以前那些国家灭亡，都是因为君主无道，可没听说过因为功臣封地多就灭亡的。”阴乡侯阴识，是贵人阴丽华的哥哥，按军功本应该增加封地，阴识却磕头推辞说：“天下刚安定，有功劳的将帅太多了，我因为是皇亲国戚，已经有了爵位，要是再增加封地，没法给天下人做表率啊。这就变成皇亲国戚靠关系受赏，而其他人靠功劳得赏了。”刘秀听从了他的意见。刘秀让各位将领说说自己想要的封地，大家都挑好县。只有河南太守颍川人丁綝只求封在自己家乡。有人问他为啥，丁綝说：“我能力不强，功劳又小，能封个乡亭就很不错啦！”刘秀满足了他的愿望，封他为新安乡侯。刘秀让郎中魏郡人冯勤负责分封诸侯的事，冯勤根据功劳大小、封地远近、土地肥瘦等情况，安排得井井有条，大家都心服口服。刘秀觉得他很能干，后来尚书的各种事务都让他总管。以前的惯例，尚书郎是从任职久的令史中选拔，刘秀开始用孝廉来担任尚书郎。
刘秀在洛阳修建高庙，春夏秋冬四季一起祭祀汉高祖、汉文帝、汉武帝；在宗庙右边修建社稷坛；在城南设立祭祀天地的场所。
长安城里粮食吃光了，赤眉军就收拾财宝，然后放火烧了宫殿和集市，到处烧杀抢掠，长安城里都没人敢走了。他们就往西走，号称有百万大军，从南山开始，一路抢夺沿途的城邑，接着进入安定、北地。邓禹则带兵往南到了长安，驻扎在昆明池，还去高庙祭祀，把西汉十一位皇帝的牌位收集起来，送到洛阳。接着又巡视各个皇家园陵，还安排了官吏士卒守护。
真定王刘杨编造了个谶语说：“赤九之后，瘿杨为主。”刘杨脖子上长了个大瘤子，就想用这个谶语迷惑众人，还和绵曼的贼寇勾结。刘秀派骑都尉陈副、游击将军邓隆去征讨他，刘杨紧闭城门不让他们进去。刘秀又派前将军耿纯拿着符节去幽州、冀州，路过的地方就慰问王侯，同时秘密下令让他抓捕刘杨。耿纯到了真定，住在驿站里，邀请刘杨见面。耿纯是真定宗室的后代，所以刘杨没起疑心，而且他觉得自己人多势众，看耿纯态度也很平和，就带着手下官员去见耿纯。刘杨的兄弟带着轻装的士兵守在门外。刘杨进去后，耿纯很有礼貌地接待他，还把他的兄弟们也都请了进去，然后关上大门，把他们全杀了，接着带兵出来。真定的人都吓坏了，没人敢乱动。刘秀可怜刘杨谋反还没行动就被杀了，就封他的儿子为真定王。
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